Bonjour à vous trois et bienvenues sur le forum!
Tout d’abord, merci pour vos encouragement, ça nous fait très plaisir!
Étudions ensemble votre itinéraire

30 Août arrivée 5h10 à Lima – journée à Lima OK.
Où logez vous ? On pourrait se rencontrer.

31 Lima / départ pour Paracas
OK

1 septembre : Le matin îles Ballestas puis bus pour Huacachina. Nuit à Huacachina.
OK

2 Huachina puis départ le soir en bus pour Arequipa
OK. Pour ces étapes, vous savez avec quelle compagnie de bus vous allez partir ?

3 Journée et nuit à Arequipa
4 Trek canyon del coca
5 Trek canyon del coca
6 Trek canyon del coca
OK pour les 4 jours. Si vous voulez on un excellent contact francophone sur lequel on a des réductions pour faire un trek un peu hors des sentiers battus

7 départ en bus (5h) pour Puno de Arequipa
OK. En partant depuis Arequipa à 5h du matin, vous pourrez aussi vous rendre sur la péninsule de Capachica le soir même et dormir chez l’habitant.

8 Lac Titcaca (îles à définir mais le choix se portera certainement entre les îles Uros, l’île de Ticonata, l’île d’Amantani ou encore sur la péninsule de Capachica)
Les îles Uros sont de loin les plus touristiques et faisables en une matinée. Si vous dormez sur la péninsule de Capachica la veille, vous pouvez très bien y rester cette journée. Si vous décidez de dormir sur Puno la veille, vous pouvez vous rendre et dormir sur la péninsule de Capachica, l’île de Ticonata, ou encore Amantani avant de rentrer sur Puno le lendemain.

9 Lac Titicaca. Nuit à Puno.
10 Départ pour Cuzco. Vous conseillez le train ou le bus ?
Des deux solutions, le bus est certainement la plus économique et la plus rapide ! Vous avez également la possibilité de prendre un bus « touristique » qui s’arrêtera sur chaque site (Pucara, Andahuaylillas, ou encore Raqchi)

11 Machu picchu / vallée sacrée et alentours
Vous pouvez consacrer cette journée à la visite de Pisaq (aller/retour) depuis Cusco. C’est une excursion très appréciée par les voyageurs. Sinon, vu que le temps est limité, vous pouvez consacrer votre journée à la visite de Cuzco, qui en vaut largement le coup !
12 Machu picchu / vallée sacrée et alentours
Cette journée, vous pouvez vous rendre à Aguas Calientes en visitant auparavant les sites de Chinchero, Maras, Moray et Ollantaytambo. Puis le train pour Aguas Calientes.

13 Machu picchu / vallée sacrée et alentours
La visite du Machu Picchu (réservez le à l’avance!) et le retour sur Cuzco (en train).

14 départ pour l’amazonie en avion
15 Amazonie
16 Amazonie
17 Amazonie
18 Amazonie puis départ pour Lima en avion
OK Pour l’Amazonie (réserve de Tambopata).

19 départ 10h25 RETOUR
Quelques questions supplémentaires :
1. Vaut-il mieux partir pour Paracas le jour de notre arrivée à Lima et ainsi « gagner » 1 jour qu l’on pourrait utiliser pour revenir sur Lima un jour avant ? Je demande cela car revenir sur Lima le 18 et avoir l’avion pour Barcelone le 19 me fait un peu peur.. j’aurais aimé avoir un jour de battement en cas de grève ou autre…
Il y a plusieurs vols par jour entre Cuzco et Lima, et plusieurs compagnies. Il est préférable de prendre un vol dans la matinée pour éviter les soucis (du moins, éviter de prendre le dernier vol de la journée au cas où). Si retard il y a, cela n’excède généralement pas 4 heures. Donc normalement, cette solution ne pose pas de problème.
Prendre un bus de nuit depuis Lima le jour même est possible, mais ça ne vous laisserait ni le temps de vous reposer (après 12 heures de vol) ni le temps de nous rencontrer !
2. L’itinéraire vous semble t-il trop chargé ?
L’itinéraire est globalement très bon. Peut-être s’attarder un peu plus autour de Cuzco et de la Vallée Sacrée (une journée de plus), mais ce sera au détriment de l’Amazonie (ou de la durée du trek dans le canyon de Colca). Si vous privilégiez l’Amazonie (qui en vaut le détour), alors ce sera très bien à condition de bien sélectionner ses visites dans la Vallée Sacrée.
3. Y a t-il un trajet en train que vous recommaderiez à tout prix ?
Au Pérou, il y a plusieurs lignes parfois légendaires… Le train est un mode de transport moins prisé par les locaux qu’en Europe, et bien souvent plus cher. La ligne la plus célèbre pour les francophones est sans doute Lima – Huancayo, qui monte au Ticlio (4818m depuis le niveau de la mer). C’est une ligne rendue célèbre par les aventures de Tintin… Mais c’est un trajet qui s’écarte des sites visités durant votre voyage. La ligne Puno – Cuzco est très belle aussi, mais vu le temps que vous avez à disposition (notamment pour voir le Machu Picchu), prendre le train pourra s’avérer être nécessaire entre Ollantaytambo ou Cuzco et Aguas Calientes. Il y a plusieurs trains dont certains possèdent une vue panoramique (Vistadome, etc.) sur la végétation luxuriante des alentours.

4. L’Amazonie est vraiment une partir importante de notre voyage, j’ai vu que les gens allez souvent à Puerto Moldano, qu’en pensez-vous ? Y a t-il d’autres lieux que vous pourriez nous recommander ?
L’Amazonie depuis Cuzco se répartit grosso modo en deux zones : la réserve de Tambopata, et la réserve de Manu. Cette dernière est plus reculée, difficilement accessible, et bien sûr moins touristique. Mais les excursions sont plus chères (le triple de la réserve Tambopata) et à prévoir à l’avance.
La réserve de Tambopata est la plus proche de Puerto Maldonado. Les excursions durent entre 3 et 5 jours.
Sinon, une dernière idée qui pourrait aussi vous intéresser : retourner sur Lima et prendre un vol Aller/retour pour Iquitos. De là, vous pourrez vous rendre en 3 (un peu juste) ou 4 jours minimum autour de la réserve de Pacaya Samiria. Cette partie de l’Amazonie (le cœur de l’Amazonie, en fait) peut même mériter un voyage à elle seule tant elle est riche ! Mais c’est probablement quelque chose qui nécessite encore « d’empiéter » sur la durée d’autres excursions (Colca par exemple).
Merci par avance de votre aide et de votre temps !
Merci à vous surtout ! Et n’hésitez pas à revenir vers nous si vous avez plus de questions

A très bientôt

Serge